Pri väčšine nádorových ochorení, kde je vhodná rádioterapia, možno uplatniť protónovú liečbu. Aké sú jej výhody? Pri štandardnej rádioterapii dochádza k stratám energie v zdravých tkanivách a do nádoru sa tak dostane len časť energie.
Aby sa nádor zničil, žiarenie prechádzajúce telom pacienta poškodí aj zdravé tkanivá, zvlášť tie, ktoré sú na ožiarenie veľmi citlivé (mozog, miecha, pľúca, slinné žľazy, sliznica zažívacieho a močového traktu a najmä tkanivá vyvíjajúceho sa detského organizmu).
Najmodernejšie metódy využívajúce pôsobenie protónových zväzkov odovzdajú väčšinu energie priamo nádorovému tkanivu, keďže zväzok zrýchlených častíc má vysokú energiu a možno ho veľmi presne zacieliť a pacienta ožarovať z mnohých smerov.
Tým sa šetrí zdravé tkanivo pred nádorom a vôbec sa nepoškodzuje zdravé tkanivo za nádorom, takže životne dôležité orgány v blízkosti nádoru možno účinne chrániť pred poškodením, a tak znížiť riziko nežiaducich účinkov liečby. Zväzkom protónov možno liečiť zhubné nádory, kde sú obmedzené liečebné možnosti a pri konvenčnej rádioterapii hrozí riziko vedľajších účinkov (napr. rakovina detského veku, nádory oka a niektorých oblastí mozgu).
Benefitom protónovej liečby je aj rýchlejšie zotavenie pacienta a vďaka presnému zacieleniu a maximálnej ochrane zdravého tkaniva aj oveľa menšie riziko vzniku sekundárnych zhubných nádorov. Vďaka vysokej pravdepodobnosti úplného zničenia nádorových buniek sa zvyšuje šanca na dlhodobé prežitie pacientov. V konečnom dôsledku sa tak šetria aj prostriedky inak potrebné na následnú zdravotnú a sociálnu starostlivosť o pacienta nevyliečeného alebo s významnými vedľajšími účinkami liečby.